Pues no hay mucho que configurar. Las instalaciones por lo general te irán diciendo paso a paso qué es lo que va siguiendo. Es posible que te atores un poco por falta de conocimiento, pero no es cosa del otro mundo. A según vayas avanzando descubrirás que ya tienes lo más importante para comenzar, que es la iMac, la 003 y Protools. Lo demás irá viniendo poco a poco.
Y la cosa es que no hay una forma única de configurar porque los sistemas son diferentes. Pero básicamente va a ser, una vez que tengas instalado tu iMac y lista la 003, al comenzar la instalación de Protools te irá guiando por el resto de los pasos a seguir. En algún momento, casi al inicio, Protools te va a pedir que conectes la interfáz. Hazlo cuando te lo pida, no antes. De ahí en adelante, será cuestión de "restarear" (no sé el término en español
) una o más veces, y quedará todo funcionando, si es que no hay ningún contratiempo.
Sólo vas a necesitar --si no los tienes ya-- Monitores o auriculares para escuchar, micrófono o instrumentos para grabar, a menos que hagas todo con instrumentos virtuales, y un controlador --teclado-- MIDI-USB para tocar y grabar.
Para todo eso hay información de sobra en este y otros foros.