Hola,
Entre otras cosas, la elección dependerá del uso que le vayas a dar.
La POD parece más orientada a la grabación y la GT-6 al directo, aunque ambas tienen modelado de amplis/altavoces + efectos y las conexiones oportunas para ser utilizados tanto en el estudio como en el escenario. Y la calidad de los dos está más que contrastada.
Lo que yo haría:
Uso sólo para grabación: POD
Uso sólo para directo (ensayos y bolos): GT-6
Uso tanto para grabación como para directo: GT-6, o POD + pedalera controladora midi
Uso en casa sin ampli: cualquiera de las dos
Uso en casa con ampli: GT-6
Probablemente el punto fuerte de la POD sea el modelado de amplis/cajas y el de la GT-6, la sección de efectos (eso no quiere decir que en el resto sean malos; ni mucho menos).
Una opción sensiblemente más barata que la GT-6, aunque con algunas prestaciones menos como p. ej. menor número de amplis modelados, es la mencionada GNX-2 de DigiTech (la GNX-3 incorpora grabación digital y alguna función más). Me abstengo de hacer comentarios sobre cuál tiene mejor sonido
También puedes ahorrarte pasta en la POD si te pillas la XT en lugar de la PRO.
Saludos.