Yo particionaria el disco externno: una parte para time machine y otra para ti.
Por otra parte, yo tengo samples, musica,pelis, fotos, etc en el externo, y los programas instalados en el propio ordenador
gracias por la respuesta pero eso de particionar es realmente necesario? quiero decir, no seria igual meter lo que tenia pensado en el disco duro todo del tirón? o tiene alguna ventaja hacerlo como me aconsejas?