Hola: a mi me pasa lo mismo con un pentium IV a 3 Gigas, pero me pasa inlcuso con pocas pistas. Eso sí, sólo sucede cuando al reproducir en play una sesión, le doy al botón de minimizar la ventana de Pro Tools.
TEngo 1024 de RAM o sea que no es por falta de memoria. La solución: nunca minimizo (para pasar al reason por ejemplo, pulso el botón de reason directamente y listo)