Como dice alcadissar en trasporte-configuracion del metronomo, ahi hay un delizador el cual te permite controlar el volumen del metronomo asi como la nota que deseas escuchar entre otras opciones.
Algunas targetas de sonido meten el metronomo y cualquier ruido que produsca el ordenador aunque francamente no he tenido este problema, pueda ser que estes experimentando lo anterior.
Un consejo válido es grabar el metronomo como audio en cubase desde una unidad externa, ahi tendras la posibilidad de subir a discrecion el volumen aparte de routearlo con mas posibilidades y lo mas importante no tendras destiempos que suelen suceder con el metronomo midi de cubase cuando le vas sumando pistas de audio. saludos