Trabaja en formato .song si vas a trabajar con audio. Si lo haces con midi sólo, hazlo en .arr.
Si vas a exportar midi por compatibilidad con otras máquinas, o sistemas operativos, (reproductores midi, mac), hazlo en Midi file.
Para trabajar con audio, debes guardar el archivo .song, las pistas wavs que generes, y en caso de que trabajes con los ediroles, todas las perfomances que generes para cada canción, así como los bancos de sonido, etc.
Pon cada pista de audio con su nombre.
Pon cada tema con sus archivos en una carpeta con su nombre.
En el pool vas a tener todos los archivos de audio que generes. Normalmente, todos serán necesarios, aunque puede que alguna basurilla se te quede por ahí. Cuanto más optimizado lo tengas, menos tendrá que cargar el Cubase al cargar el tema.
Orden, orden, orden.