Hola
Tunnko
Me parece extraño que a la hora de copiar el fichero MIDI se haya "convertido" en SMF SongMidiFile.
Si estas en un sequenciador con el archivo abierto, y el archivo sigue siendo song MIDI, quiere decir que, a lo mejor, al guardar en el disquete (desde el sequenciador) se te haya pasado por alto, el formato en que lo guardas.
Puede ser que sea este tu problema.
Saludos