Ante todo aclarar una cosa. Estos plugins no procesan nada, son medidores, picómetros que funcionan de un modo diferente a los tradicionales. Inserta el medidor en el ultimo lugar de los plugins en tu canal Master de pro tools. Si lo envías todo a un bus y grabas ese bus (como es habitual en post) entonces el master ha de ser el del Bus que uses para volcar el audio. No hay nada que procesar, el pluguin te sirve de guía para saber si te estas quedando bajo de nivel o demasiado alto y en consecuencia mezclar de manera correcta.
Si lo envías todo a un bus y grabas ese bus (como es habitual en post)
Un poco de off topic. ¿Desde que está el bounce off line sigues trabajando así? No sabes lo que me cuesta hacerles entender el porqué de la metodología a los chicos que me ayudan ahora.