Christian, el subkick de big room efectivamente, tiene su tono, osea lo acabas de comprobar tu mísmo, más pruebas no te faltan, y debería ir el tono de ese subkick acorde con la canción, osea que combine y no quede como un ruido fuera de tono simplemente para que se oiga el "Prrrrr", si el "Prrrr" suena en su tono, sonara más homogéneo con la canción, y a lo mejor tienes el problema de que lo pones donde te suena bien, pero no es donde debería ir en relación a la canción. Eso a mí me da mucha rabia cuando me pasa con algun subbajo cuando lo pongo donde suena bien, pero no queda bien con la canción, total que si lo pongo donde debería ir, queda muy agudo, y si intento bajarlo una octava para que no quede tan agudo, queda demasiado grave y fangoso.
Mmmm veo 3 soluciones posibles...una segura, otra probable pero sencilla, y otra sencilla pero poco probable.
1 - Coloca el subkick donde te suene bien y vete a todos los instrumentos y su propia melodia la colocas en otro tono que combine (puede ser trabajoso y a lo mejor por querer cambiarlos todos hay alguno que deja de sonar como te gusta)
2 - Coloca el kick donde debe sonar aunque te suene demasiado agudo, y aplicale un filtro de paso bajo para darle un poco de redondez y amortiguar un poco el llamativo sonido agudo (...no sé si te funcionará)
3 - Deja el kick donde debe sonar con respecto la cancion, y cuando la termines, bajas el pitch hasta que el subkick quede bien (yo esta opcion no la usaria porque hay sonidos que se pueden estirar o acortar, y a veces incluso hay instrumentos que desafinan etc.
No sé que más soluciones puede haber, osea esas 3 las he dicho porque es lo que yo probaría, yo no tengo estudios de producción musical ni de mastering y por tanto, estas posibles soluciones las aporto por mi propia lógica, pero en fin, espero que te arreglen el problema. Un saludo!