los 2 son formas de trabajo de tu placa base/cpu/sistema operativo
La diferencia básica es que el ACPI controla la cantidad de energía y el tiempo de inicio del uso de esta misma de cada dispositivo, así como su tiempo de término de uso. Este tipo de configuración funciona muy bien para las portátiles.
Hay que tener muy bien configurado tu máquina, ya que a veces las placas bases no son compatibles con acpi, lo que puede ocasionar problemas con tu placa de sonido, video, o cualquier interfaz tipo usb o firewire y sus respectivas irqs. Mostrándote las temibles pantallas azules.
Saludos
hurm