Un automatización es justo eso que has dicho, un envio de un efecto en una parte concreta de una pista en un momento que se haga de forma automática.
No se que tipo de DaW o editor usas. Pero por ejemplo en FL studio que es el que yo uso hay varias formas de hacerlo pero la más facil es crear un clip de automatización, una especie de linea temporal que se crea en la pista y en la que puedes cambiar los parámetros. Añadir puntos para subirlos o bajarlos en esa linea. La linea puede ser por ejemplo el volumen del master o el volumen de un efecto (reverb, phaser...) que aparecerá en el momento que quieras en la pista que quieras.
No se si me explico. MEjor un video:
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Saludos!