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Una forma que se me ocurre, si lo que quieres es grabar EZDrummer y no los sonidos propios de la batería, es simplemente grabar la interpretación completa de la batería por MIDI, luego mostrar las notas en diferentes colores en el editor de FL Studio, ir seleccionando las notas del mismo color (cada uno corresponderá a un elemento de la batería distinto, claro) y pegándolas en un nuevo patrón.