Problema extraño con el Bounce

Hola! Estoy intentando hacer el Bounce de una de mis creaciones para pasarla a MP3 y WAV, el problema que tengo es que al hacer el Bounce, una pista baja 2 semitonos desde el minuto 6:37 hasta el final de la cancion, lo arregle subiéndole dos semitonos desde el proyecto, y aunque suena mejor, hay una desafinaron notable (el instrumento es el Upright Studio Bass) Alguien sabe a que se debe este error y como solucionarlo? Uso Logic Pro X 10.4.8 y para grabar uso un M-audio ProKeys sono 88 y un Akai MPK3 mini, ambos conectados vía USB