Tu crees que lo grabas a la vez, pero no es así.
Para esto, hay una función arriba que te lo cuantiza automáticamente. 1 beat per minute (BPM) es 1/4 de cuantización.
Cada golpe que des entre beat y beat, solo podrá significar una única nota, encajada en la rejilla, si como digo hablaramos de 1/4 de cuantización-precisión.
Cuanto más cuantices, más precisas y numerosas podran ser las notas que toques, siempre claro está, ajustado a la rejilla.
Se presupone que dada una cuantizacón, sirve para corregir pequeños desfases, pero si te pasas un "cuadradito de rejilla" en el tiempo, el pograma lo meterá automáticamente en la siguiente franja de cuantización.
La foto que pones no ayuda gran cosa, debes pinchar dentro de la pista para ver el arreglo con un buen zoom, ver donde te las está insertando, y que cuantización y de que tipo tienes asignada (esto aparece arriba, por donde pone "tiempo", que debería de estar por cierto ajustado a cuantización)
Estas grabando con metronomo si? Quizas has activado la cuantizacion automatica (me parece que he visto una opcion asi en nuendo) y el cubase te esta ordenando todo de manera distinta que lo que grabas... bueno que puedo saber... en el tema MIDI soy 90% ignorante, pero era una idea jaja.
Pues dejanos saber si logras resolver esto, asi cuando nos suveda a los que no sabemos mucho de midi podemos arreglar