Desactiva provisionalemente las que no te interesen, y haz de nuevo el Merge MIDI.
Las desactivo, e incluso borro todo lo que habia editado en ellas, pero a la hora de "mezclar MIDI en loop" (del menu MIDI) mezcla todo lo que habia escrito en un solo track, no solo las inserciones que habia hecho para ese track, sino todas las inserciones realizadas en todos los tracks, no se como resolverlo.
Un saludo
Oks ahora entiendo tu pregunta.
La única manera de que únicamente se haga el Merge de la pista que quieres es dejando ese track en 'solo' y las demás en 'mute'.
Saludos.