No todo se puede pasar a midi...
Depende mucho del material, si es monofónico o no, si el fraseo es más o menos claro, etc.
Si es monofónico el algoritmo de detección de notas tendrá menos problemas (no significa que no los tenga, claro, dependerá del material), y si es polifónico...

en fin, siempre puedes rezar. Me fío mucho mas del oído humano que de una máquina, la verdad. La máquina siempre necesita de un humano que confirme y corrija sus resultados, se equivocan con frecuencia.
Seguramente algunos mejor informados que yo conocerán software de detección de notas especializado en material polifónico, no dudo que lo haya (y se han hecho muchos avances en esta dirección).
No te puedo recomendar ninguno por 2 razones:
1- No lo uso, y no se cual cumple mejor su propósito.
2- (En mi opinión) si quieres saber qué notas son, lo mejor es empezar a ejercitar tu oído (puedes ayudarte con un piano o lo que sea) con cosas fáciles. Si el material a tratar es difícil para ti, también lo será para una máquina. No lo dudes.