Para producir el master y copiar a CD usa siempre Wav. El mp3 solo sirve para subir canciones a la red o ponerlas en el ipod.
En el menú archivo busca exportar mezcla de audio y selecciona el tipo e archivo que deseas que resulte de la mezcla (mp3, wav...etc), fijate que debes seleccionar como quieres que te exporte el archivo - si en estereo entrelazado, mono etc,etc- y la calidad del mismo.
Un saludo.