A ver, tu pregunta da a entender otra cosa. Así tal cual lo preguntas yo entiendo que te preocupa que los 440 hz de un LA al ser digitalizados ya no sean 440 hz si no otra frecuencia, por ejemplo 445 hz, es por decir cualquier burrada. Pues no, eso no pasa, las frecuencias no se desplazan.
A mi lo que me preocupa es el orden en que la gente comienza a aprender las cosas (vicios que nosotros mismos fomentamos). Antes de preguntar esto lo propio sería entender en que consiste la digitalizacion.
Tu problema claramente no es no saber si se modifica la frecuencia, tu problema es no saber nada respecto a digitalizar señales, y sin eso no tiene mucha razón de ser andarse preocupando por lo otro, pero ya que estamos acá te lo voy a intentar explicar de forma corta.
Al digitalizar lo que se hace es tomar valores de amplitud instantaneos de la señal, es decir, se mira la señal en determinado momento y el valor de amplitud que posea en dicho momento se registra. A ese valor de amplitud se le asigna un codigo de bits. Como es un valor instantaneo, es decir en un instante de tiempo cortito, pues no te sirve para representar toda la señal, lo que debes hacer es registrar el valor de la señal varias veces por segundo durante todo el tiempo que dure la señal.
Como ya te explico mas atrás un sonido real no es una sola frecuencia, es la suma de varias, por lo tanto para registar un sonido tal cual lo escuchas, debes registrar todas las frecuencias que interactuan con tu oído, y como el ser humano escucha hasta al rededor de los 22 khz, pues se digitaliza a 44 khz.
Por que se digitaliza a 44 khz si lo mas que escuchamos es a 22 khz??? pues por que dicha frecuencia, los 44 khz es la velocidad con la que se van a tomar las muestras, es decir, lo que te conté en un principio, ir a mirar el valor de amplitud instantaneo de la señal y registrarlo, eso se hace a una velocidad de 44 mil veces por segundo.
Cuando tu recoges los valores de amplitud de la señal 44 mil veces por segundo no quiere decir que ahora las frecuencias de la señal original viajen a 44 mil veces por segundo, no se multiplica la frecuencia de la señal real por la frecuencia de muestreo, tu lo único que estas haciendo es 1 segundo de señal registrarlo 44 mil veces, pero sigue siendo siempre 1 segundo. Diferente sería si cambias la frecuencia a la que reproduces la señal digitalizada. Si tu digitalizaste a 44 khz un segundo de sonido va a durar lo mismo que un segundo de la señal real, pero si lo reproduces a otra frecuencia, por ejemplo 88 khz, ahora en un segundo van a pasar 88 mil muestras, es decir el doble, compactando tu señal que duraba un segundo haciéndola caber en medio segundo. En ese caso si se modifica la frecuencia, al reproducirlo a una frecuencia distinta a la que se grabó.
Lo que te ha mostrado mordus, dice que para poder reproducir una señal digitalizada sin alliasing la frecuencia de digitalizacion debe ser el doble de la frecuencia máxima de la señal. Es decir, que si bien la nota LA son 440 hz, una nota de una guitarra no produce solo esa frecuencia, produce varias que se suman dando el sonido caracteristico de la guitarra, esa suma de señales tiene frecuencias que sobrepasan los 440 hz y que se pueden extender hasta el tope del rango audible, es decir hasta 22 khz o mas, entonces para registrar todo ese contenido de frecuencias que tiene una nota de la guitarra, necesitas digitalizar utilizando una frecuencia el doble de la frecuencia máxima que tenga la señal, como la guitarra puede tener frecuencias por arriba de los 22 khz que es hasta donde escucha el ser humano debemos filtrarla hasta donde escuchamos, deshacernos de todo el contenido fuera del rango audible, y luego se puede digitalizar, es lo que ocurre cuando seleccionas los 44 khz, se filtra todo lo que puede estar por arriba de 22 khz y toma luego las muestras al doble de dicha frecuencia máxima, con eso te aseguras de registrar desde 0 hz hasta 22 khz, todo ese rango de frecuencias puedes tener en un sonido del mundo real, ya que lo mas importante acá y que debes comprender es que nunca va la nota sola, todo sonido es una suma de varias frecuencias mas a parte de la fundamental.
Me alegro de que te haya servido. 
