Hola: de entrada, deshabilita en la bios la tarjeta de sonido integrada de la placa base. Si con eso no se eliminan los problemas, prueba a jugar con el búffer, bajándolo para grabar y subiéndolo para reproducir..............
Las cifras de búffer a utilizar dependerán de la capacidad de tu procesador, pero vamos, con un par de pruebas darás con las cifras adecuadas y eliminarás esos saltos en el audio.
Un saludo.