Hola.
Puedes grabar la secuencia midi problemática a .aiff y mezclarlo como audio, regulando el volumen a placer.
quieres decir que haga un bounce de solo ese midi transformandolo en audio y luego volver a hacer bounce de los dos audio¿?
Normaliza si te queda bajo en ganancia.
mod
Si es un sinte externo tendrás una entrada de audio y al secuenciador a un auxiliar o pista de audio si la quieres grabar, si así te queda baja inserta en el canal el plugin gain que esta en el menú utility para aumentar el volumen.
Un Saludo