Puede ser por varias causas:
1º, A lo mejor tenias activado algún ajuste de autonivel al grabarla, lo cual, si te pasas de volumen cuando estás metiendo sonido por la tarjeta (cerca de clipear) te baja los niveles automaticamente.
2º, Depende de que editor de audio uses, hay algunos que te bajan el volumen automáticamente. Incrementa la señal en el mismo editor, y ya está.
Como no especificas mas, no me atrevo a aventurarme demasiado. Dí que tarjeta usas y que secuenciador o con que te manejas para dar mas ideas.
BrX.